祁连山的东坡和北坡的降水多，东坡降水多的原因是来自太平洋的湿润水汽在坡上升形成地形雨，而北坡降水多是来自北冰洋的水汽在迎风坡形成降水，西坡和南坡的降水较少。

祁连山的北侧与南侧分别以明显的断裂降至平原。北坡与河西走廊间相对高度在2000米以上，而南坡与柴达木盆地间仅1000余米，狭义的祁连山仅指最北一列。

它是黄河和内陆水系的分水岭。

扩资料：

在林区，随着海拔的增高，大气中的水汽含量和尘埃减少，大气透明度增加，太阳总辐射量加大。该地区4－12月份山上的云雨比山脚地带显著增多，日照时间显著减少，山区的总辐射，反不如山脚地带高，因而太阳总辐射和日照年总量山上比山脚少。

月总辐射及日照时数最大值均出现在4月。最小月总辐射量出现在太阳高度角较小而日照又较短的2月。同时，光照和幼树的生长的关系也十分密切。

光照充足的地方一般温度较高，郁闭度较小，营养空间较大，有利于幼树的生长更新。