微生物(microorganism)是存在于自然界的一大群体形微小、结构简单、肉眼直接看不见，必须借助光学显微镜或电子显微镜放大数百倍、数千倍，甚至数万倍才能观察到的微小生物。

我们要认识、研究和利用各种微生物资源也必须对它们进行分类。生物名称分两类，一类是区域性的俗名（vernacular name）；

另一类是国际上统一使用的名称，即学名（scientific name）。俗名是一个国家或地区使用的普通名称，如我们把引起人结核病的细菌叫“结核杆菌”，俗名的优点是在一定的区域内通俗易懂便于记忆，但俗名有局限性，尤其是不便于国际间的交流。

目前，学术界采样国际命名法命名，即采用林奈氏 (Linnaeus) 所创立的“双名法”，由二个拉丁字或希腊字或拉丁化了的其它文字组成，一般用斜体表示：如Bacillus subtilis。

若所分离的菌株只鉴定到属，而未鉴定到种，可用sp来表示，例如Bacillus sp。1.分类单元的命名

所有正式分类单元（包括亚种和亚种以上等级的分类单元）的学名，必须用拉丁词或其他词源经拉丁化的词名。

⑴ 属名 属名用一个单数主格名词或当作名词用的形容词来表示，可以是阳性、阴性或中性，首字母要大写。

⑵ 种名 和其他生物一样，细菌的种名也用双名法（binomial nomenclature）命名，即种的学名由属名和种名加词两部分组合而成。

一、次为属名，首字母要大写；

二、词为种名加词，常用形容词（要与属名性别一致），也可以用人名、地名、病名或其他名词（名词用主格或所属格形式），种名加词首字母不大写。

⑶ 亚种名亚种名为三元式组合，即由属名、种名加词和亚种名加词构成。

⑷ 属级以上分类单元的名称 亚科、科以上分类单元的名称，是用拉丁或其他词源拉丁化的阴性复数名词（或当作名词用的形容词）命名，首字母都要大写。

其中细菌目、亚目、科、亚科、族和亚族等级的分类单元名称都有固定的词尾（后缀）。此外，在分类单元名称的后面还可以附上命名人的姓名和命名年号。