这是由于在发情期的原因。

松鼠约于每年春季1、2月发情，发情期大约为两个星期左右。松鼠繁殖开始的适龄期，雌性为8～9周龄，雄鼠为9～10周龄。

对松鼠来说，秋季也有一个发情期。在非繁殖季节，雌雄性成体分别占据一定的地方作为自己生活的活动范围。在野外，雌性保护一定面积的地盘是为了保护食物，其内不允许其他同种个体进入，对雄性个体也是如此。

但是在繁殖季节，则明显地放松对领域范围的保护，允许雄性个体进入。

发情时，雌性个体食欲下降、活动加强，烦躁不安，呈兴奋状态；有时舔外阴部，且排尿频繁，并发出尖尖的叫声，允许雄性个体的靠近；

此时阴门颜色变深且红肿，有时有白色或微黄色粘液或凝乳状的分泌物流出。

在人工饲养条件下进行繁殖时，一定要挑选体格健壮，毛色光泽佳，精神状况好，食欲旺盛的个体。对雄性个体则要求性欲旺盛配种能力强；

而对雌性则要求母性强，胎产数多，泌乳量充足的个体。配种时以一雄一雌或一雄多雌的交配方式，松鼠怀孕的时间大约为35～40天，4月初进入哺乳期，每年能产仔3次左右，每次能产4～6只。

只要食物充足，松鼠的雌性个体就能繁殖较多个体，有着较强的繁殖力。初出生的幼仔以母体乳汁作为全部营养需求的来源，因此，此时应该要特别注意母体的营养状况，小松鼠刚生下时很小，看不见东西，发育很慢，生下将近30天时才睁开眼睛；

至一个半月时，小松鼠才愿意到室外进行活动。