1、定点医院不同：

省直医保针对省直单位职工的医疗保险，定点医院较多，而市医保是负责市直单位的医疗保险；定点医院在本市范围。

2、报销比例、待遇不同：

各地情况不一样，一般是省医保报销比例高于市医保。

3、参保人员不同：

省医保参保人员是省直单位的职工和档案在省人才代理中心保管且办有省养老统筹的办理；

市医保只能是市直单位的职工和档案在市人才代理中心保管且办有市养老统筹的办理。

法律依据：《中华人民共和国社会保险法》

第二条 国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度,保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。

第二十六条 职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。

第二十八条 符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。